Si desea evitar posibles accesos no autorizados, inserción de código malicioso, u otros posibles problemas de seguridad luego de haber instalado Joomla!, tenga en cuenta los procedimientos que indicamos a continuación:

1. Si modifica la clave cPanel o FTP, la nueva clave debe ser compleja y combinar por ejemplo letras mayusculas, minusculas y números si es posible.

2. Tener actualizado el gestor de contenidos de su sitio web (CMS) a la última versión disponible.

3. Verificar cuales plugins y plantillas utiliza actualmente, y desinstalar los no utilizados.

4. Verificar si los plugins y plantillas actuales poseen problemas de seguridad buscando referencias en Google.

5. Actualizar los plugins y plantillas.

Siempre que haga una instalación desde cero, tenga en cuenta:

- Instalar versiones oficiales de Joomla! de sitios de confianza como www.joomla.org o www.joomlaspanish.org

- Cambiar el nombre de usuario administrador por defecto (admin).

- Eliminar archivos no necesarios del gestor de contenido.

- Verificar referencias de vulnerabilidad que tengan los componentes que desea utilizar en su gestor de contenido.

- Descargar los componentes, plantillas y elementos del CMS desde sitios oficiales y de confianza, que no incluyan cracks, o desde sitios de descargas ilegales.

- Revisar el código de los componentes instalados, en busca de posibles vulnerabilidades o código oculto con propositos diferentes.

- Remover componentes no utilizados.

- Evitar que archivos del CMS o de los componentes tengan código encriptado ilegible que utilizan diferentes técnicas como base64 entre otros.

- Reforzar la seguridad del sitio con un .htaccess correctamente configurado.

- Tener actualizado a la última versión del gestor de contenido si es posible, está es la causa principal de vulnerabilidades.

- Verificar constantemente si han sido publicadas actualizaciones o mejoras de seguridad para la versión del CMS que utiliza actualmente, en sitios web de confianza como www.joomlaspanish.org o www.joomla.org.

- Realizar copias periodicas de su cuenta de hosting (1 al mes por ejemplo).

- Actualizar las claves de cPanel, FTP y administrador Joomla! por contraseñas complejas que contengan Mayúsculas, Minúsculas, números y simbolos.

- Verificar que los permisos de los directorios dentro de public_html sean 755 y de los archivos 644.

- Verificar los error_log de las carpetas dentro de public_html

- Verificar el log de errores de apache desde el cPanel.

- Revisar el código del archivo .htaccess del sitio web dentro de public_html.

- Verificar que en el código fuente de los archivos dentro de public_html no incluyan iframes o scripts sospechosos (normalmente ubicados al inicio o final de los archivos).

- Revisar que el contenido del archivo configuration.php no tenga código malicioso, y descargar una copia de dicho archivo.

- Realizar una copia de los archivos  como imagenes o documentos (NO GUARDAR LOS DIRECTORIOS COMPLETOS, y de hacerlo, verificar que solo existan imagenes o archivos personales) y descargarlos.

- Realizar una lista de los componentes utilizados.

- Eliminar todo el sitio web Joomla!.

- Subir un Joomla! limpio descargado de un sitio web de confianza ( joomla.org ).

- Eliminar la carpeta installation.

- Resubir la copia del archivo configuration.php a la carpeta public_html.

- Resubir la copia de las imagenes y archivos personales a las respectivas carpetas.

- Instalar los componentes (plantillas y extensiones) requeridos con instaladores descargados de paginas web de confianza y preferiblemente más actualizados.

Por ultimo, tenga en cuenta las siguientes recomendaciones, a efectos de optimizar la seguridad:

- NO guardar el usuario y clave de acceso FTP en el programa FTP utilizado (Ej: FileZilla).

- Examinar los equipos desde los cuales normalmente accede al administrador de la pagina, cpanel o FTP, con un antivirus actualizado y también con un AntiMalware (Un antivirus solamente no es confiable).

- Modificar el prefijo de base de datos, no utilizar el prefijo por defecto jos_ para las tablas.

- Verificar desde el panel administrativo de hosting cPanel si han sido creados subdominios o dominios parqueados de forma no intencionada.

- Si es posible, editar en los archivos php de los componentes, el número de versión de los componentes.

- Asegurarse de eliminar los archivos que puedan quedar al eliminar cualquier complemento de Joomla!.

- Proteger el acceso a /administrator.

- Eliminar referencias en tags y metadescripciones a "Joomla!".

- No utilizar complementos que no hayan sido actualizados hace más de un año.

- Aumentar la seguridad con componentes especiales e instalar componentes que faciliten el proceso de backup de un sitio Joomla (http://www.tisnado.com/blog/seguridad-en-sitios-con-joomla)

Una vez haya seguido todas las recomendaciones anteriores, y efectuado los procedimientos indicados, habrá optimizado la seguridad de su sitio web de manera exitosa!